Sul Bollettino Ufficiale della Regione Puglia n. 28 dell'11.02.2010 è stato pubblicato il Disegno di Legge n. 6 del 02.02.2010, inerente l'istituzione del "Parco Naturale Regionale Medio Fortore".
Il Parco avrà l'obiettivo di costituire un primo elemento di connessione fra l'Appennino Dauno e la costa garganica, costituendo proposta e modello per la realizzazione di un sistema di tutela e valorizzazione che possa essere esteso all'intero corso fluviale.
In particolare, fra le finalità del progetto figurano: conservare e recuperare gli equilibri ecologici, nonché le biocenosi, con particolare riferimento agli habitat e alle specie animali e vegetali; ripristinare e rinaturalizzare gli ambienti e il paesaggio fluviale, le zone umide e gli ambienti ripariali, incrementandone la superficie e migliorandone la funzionalità ecologica; ridurre i fenomeni di frammentazione degli habitat; monitorare l'inquinamento e lo stato degli indicatori biologici degli ecosistemi fluviali, umidi, costieri e boschivi; ...
La sorveglianza sull'osservanza degli obblighi e dei divieti di legge sulle attività consentite all'interno del Parco sarà affidata ad un apposito Consorzio di gestione, costituito dal Comune di San Paolo Civitate e dal Comune di Lesina; agli agenti di polizia locale, urbana e rurale; ai nuclei di vigilanza territoriale della Provincia di Foggia e alle Guardie Ecologiche Volontarie. L'utilizzazione delle guardie venatorie volontarie sarà subordinato alla stipulazione di apposite convenzioni con l'Ente di gestione.